长期吃豆腐脑会造成营养不良，严重时会引发结石。
大量食豆腐脑很容易引起碘的缺乏，发生碘缺乏病。豆腐脑中含有极丰富的蛋白质，一次食用过多，不仅阻碍人体对铁的吸知收，而且容易引起蛋白质消化不良，出现膨胀、腹泻等不适症状。在正常情况下，人吃进体内的植物蛋白质，经过代谢变化，最后大部分成为含氮废物，由肾脏排出体外。
建议:豆腐脑不能与含草酸高的食物一起吃，其原因是豆腐含钙高，钙与草酸可生成难溶或不容的草酸钙，影响钙的吸收。如菠菜、竹笋、苋菜等含草酸高的菜。豆腐脑也不可常吃，建议丰富饮食结构。