紧急避孕药中的雌、孕激素对胎儿的性器官发育会产生一定的影响。
避孕药中的人工合成的孕激素可能会使女性胎儿男性化,另外，避孕药中的雌、孕激素作用于胚胎,有可能造成孕妇流产或使胎儿发生畸形。
如果想保留胎儿,可做好孕产期检查（如怀孕14－20周进行唐氏筛查,怀孕22－26周进行彩超排畸检查）,有异常情况及时处理。