胃镜肠镜一般来说不能同时进行。
因为胃镜是从口腔开始进入检查，而肠镜是从患者的肛门进入检查。虽然这两种检查方式互不干扰，但是患者在做胃镜或者肠镜检查的时候，身体难免会有一些痛苦。而且一般做胃镜检查，患者要禁食禁饮，但是肠镜的患者前面要喝大量的泻药，引起导泻，做肠道准备，肠子清洁准备之后患者才能进入肠镜检查。如果患者确实有胃肠两方面的疾病，最好先做胃镜检查，然后再做肠镜检查。
建议选择正规医疗机构就诊，胃肠镜检查应该注意吃无渣或者少渣的食物。前一天仅能吃流食，如鱼、蛋、牛奶、豆制品、粥、面条、面包、香蕉、冬瓜、马铃薯等。检查的当天早中餐均应禁食，清洁肠道。