吃南瓜的好处是缓解便秘。坏处是会引起胃食管反流，反酸等不适。
南瓜含有丰富的膳食纤维，对便秘的人推荐使用。但对于胃食管反流病患者吃南瓜相对不好消化，会加重病情；糖尿病的人也要适当食用。其好处就是能够促进肠道的挪动，缓解便秘。坏处可能就是会引起胃食管反流，烧心，反酸等不适。无论哪一种食物或者是药物都具有偏性，因此不能认为吃南瓜有好处，就长期大量的食用。
建议由于南瓜含维生素C分解酶，所以不宜富含维生素C的蔬菜、水果同时吃。维生素C耐热，南瓜煮熟后此酶即被破坏。所以南瓜宜煮食，不宜炒食，更不宜与番茄、辣椒等同炒。