肛瘘手术花费一般三甲医院四到五千元左右。职工医保报销百分之七八十。新农合报销30%到50%。
肛瘘手术比较复杂，有低位肛瘘和高位肛瘘。如果是一个简单的低位肛瘘，可以在门诊部局部麻醉下切除，费用相对较小，大概在3000元左右。省外医院的报销比例较低，当地乡镇医院的报销比例相对较高，县医院的报销比例也会降低，此外，有很多的自费药物和相对较少的报销，费用在40000元左右。一般情况肛瘘手术费用因为就诊医院不同以及手术方式差异有明显不同，可以到当地正规综合性医院肛肠科明确具体手术方式以及费用。