变态反应是发病的主要原因，有内在和外在方面，如病灶感染、致敏的食物、药物或接触某些致敏物品。存在痔疮、肛瘘、肛裂、肛门失禁、肛管上皮缺损等，容易造成肛门湿疹。摄入鱼、虾、蟹、牛羊肉、鸡蛋、葱、蒜、酒等刺激性食物，也可能会造成肛门湿疹。