近视眼手术半秒和全秒的区别在与手术的过程不同。半飞秒激光一般是通过飞秒激光代替机械的制作瓣膜，然后再用准分子激光的方法进行角膜切削，从而改善近视的情况。全飞秒激光一般是不需要制作角膜，是利用角膜基层进行不同深度的激光爆破，从而形成基质透镜，可以改善近视的情况。