治疗毛囊炎可以使用外用药物，也可以通过口服药物的方式。
如果毛囊炎的症状比较轻并且范围比较小，可以选择外用药物进行治疗，较为常用的药物有克林霉素凝胶和夫地西酸软膏，如果是真菌感染所造成的，通常需要使用益康唑乳膏或者特比萘芬乳膏，有利于改善症状，减轻皮肤瘙痒和肿胀现象。
平时需要做好皮肤表面的清洁工作，经常洗澡。