头发斑秃病因不明。在毛囊周围有淋巴细胞浸润，且本病有时合并其他自身免疫性疾病，故目前认为本病的发生可能存在自身免疫的发病机制。遗传素质也是一个重要因素，可能与HLAⅡ型相关，25%的病例有家族史。此外，还可能和神经创伤、精神异常、感染病灶和内分泌失调有关。