儿童大便不成形消化不良可以在医生的指导下服用益生菌调理，也可以服用健胃消食片、乳酸菌素片等药物治疗。
儿童大便不成形消化不良可能是因为功能性消化不良导致的，这种疾病和心情有一定的关系，而且病情容易出现反复性发作。
在治疗期间不可以吃寒凉以及辛辣的食物，比如辣椒、冰淇淋以及大蒜，以免影响药效吸收导致病情加重。