儿童功能性消化不良，可以在医生的指导下服用促进胃肠蠕动的药物。
促进胃肠蠕动的药物有四磨汤口服液、儿童健胃消食片、乳酸菌素颗粒、小儿健脾开胃合剂等，这些药都可以治疗胃肠道紊乱，减少胃肠的负担，在服用药物时切不可私自盲目增加或减少药量，一定要在医生的指导下服用，避免出现不良反应。
饮食上要吃易消化的食物，例如胡萝卜、山药等。