儿童肛肠疾病一般可以通过局部用药的方法治疗，也可以通过手术切除的方法治疗。
小儿肛肠疾病，如果是由于肛裂或者是肛瘘的原因，病情不是很严重，一般可以通过局部用药的方法进行治疗。病情较严重者，可以采用手术切除的方法进行治疗，有利于病情的恢复。
在治疗期间应控制孩子的饮食，尽量不要吃一些辛辣和刺激性的食物。