肛门疣常见的疾病有尖锐湿疣、扁平湿疣等，尖锐湿疣是人乳头瘤病毒感染引起的性传播疾病，而扁平湿疣是二期梅毒疹的一种特征性表现，如果是尖锐湿疣可以通过激光、冷冻、药物点蚀、电灼等治疗，梅毒治疗首选青霉素，经过治疗后扁平湿疣自然消退，这两种疾病都是性病，到皮肤科或者皮肤性病科诊疗。