月经12天了还没干净会导致不孕，月经12天了还没干净属于月经期过长，月经少。月经是子宫内膜脱落出血引起，受到卵巢分泌激素调节。引起月经长时间不干净的原因最常见的是功能性子宫出血，这个是卵巢分泌激素失调，导致子宫内膜脱落不干净。