巧克力囊肿不属于生理性囊肿，一般不会自行消失。囊肿小于5厘米以下，可以暂时先观察，大于5厘米以上，为了避免发生扭转，需要进行手术治疗。每半年至一年复查一次B超，看一看囊肿大小。如果需要手术治疗，也可以去正规医院选择腹腔镜等微创疗法进行治疗。