子宫内膜薄有时候是会引起胚胎停育的。胚胎停止发育的原因有很多种，孕早期胚胎停止发育的原因主要有胚胎染色体异常、黄体功能不全、甲状腺功能减退、免疫系统异常等。孕中期胚胎停止发育的原因主要有子宫解剖结构的异常、免疫系统异常以及血栓前状态等。