巧克力囊肿的怀孕几率要结合囊肿的大小以及病程的长短来看。巧克力囊肿随着月经次数增多，会逐渐长大发生破裂，囊液流入盆腔，从而引起输卵管黏连堵塞，导致怀孕几率下降。如果是巧克力囊肿的早期，囊肿未破裂，输卵管走形正常，则仍然有较高的怀孕几率。