皮脂腺囊肿手术可能会留疤，但是并不会很严重。皮脂腺囊肿一般属于良性的肿瘤，可以通过手术的方法治疗，因为手术的伤口比较小，因此疤痕也会比较小。如果留下了疤痕可以在局部涂抹去疤膏治疗，能够促进疤痕修复，必要时也可以选择激光治疗，可以促进皮肤胶原蛋白再生，从而达到比较好的效果，需要到正规的医疗机构治疗，还要注意做好局部皮肤的护理工作。恢复期间需要注意保持伤口的部位清洁卫生，不要让伤口沾水，以免诱发感染。