结膜炎的治疗原则是对病因进行治疗，主要是局部用药，必要时全身用药，急性期不包扎。左氧氟沙星滴眼液主要用于细菌性结膜炎，每1-2小时一次，病情改善后滴数减少。病毒性结膜炎夜间应涂阿昔洛韦滴眼液或更昔洛韦眼用凝胶，并涂氧氟沙星眼膏。如果结膜囊分泌较多的时候，可用生理盐水每天冲洗结膜囊1-2次。如果是严重的结膜炎，如衣原体性结膜炎和淋球菌性结膜炎，除了要对局部用药之外，还对全身服用与之相对应的抗生素。