男性HPV16阳性是可以自愈的。男性，如果只是发现高危型HPV16感染，但是没有疣体，是不需要治疗的。临床上其实不光是男性，对女性也是一样的，只有高危型HPV感染的患者是可以通过自身抵抗力的提高，来清除病毒的，不需要特别进行治疗，恢复时间在半年到一年，看个人抵抗力来定。