手指甲出现凸凹不平最常见的原因就是维生素或者微量元素的缺乏，有必要到医院进行微量元素的检测，根据微量元素的检查结果有针对性的给予补充，平时需要均衡的饮食，合理的营养，不能有偏食挑食的情况，多吃蛋白质和维生素丰富的食物。其次真菌感染也会导致指甲凸凹不平，如果有灰指甲或者有真菌感染，需要使用抗真菌的药物进行治疗。甲床的先天发育异常，也可能导致指甲凸凹不平。