女性生殖器疱疹一般发生的部位是在大小阴唇、阴阜、阴蒂、子宫等部位，也可以在肛周、腹股沟、臀部等部位出现。生殖器疱疹会在皮肤上出现散在的小水疱，或者是簇集状存在的小水疱。小水疱一旦出现以后，2到4天会破溃，形成浅浅的溃疡，然后慢慢会愈合。