扁桃体发炎可分成急性扁桃体炎和慢性扁桃体炎，二者病症各有不同。急性扁桃体发炎时全身病症重，可发生畏寒怕冷、寒战、高烧、食欲不佳、浑身酸痛等病症，部分病症显著，发生咽喉痛、吞咽障碍。还可发生晚间影响睡觉，特别是儿童能够发生晚间惊醒、又哭又闹不安等病症。慢性扁桃体炎病人能够发生咽喉部不舒服、咽喉部阻塞感的病症。因为口腔内病菌繁殖，扁桃体内长时间有脓物堵塞，所以发生口臭。扁桃体肿大的病人还可发生呼吸困难，睡觉时打呼噜等病症，假如病人发生扁桃体内的病菌吞进消化道，还可发生消化不好的病症。