目前治疗幽门螺杆菌的方法是四联疗法，治疗14天，就是用一种PPI制剂加两种抗菌素加铋剂。
幽门螺杆菌会在其胃内寄生，一般可以通过碳13或胃镜来检测。幽门螺杆菌四联疗法即四种药物治疗，包括铋剂、质子泵抑制剂、两种抗生素。质子泵抑制剂包括奥美拉唑、雷贝拉唑、艾普拉唑、兰索拉唑、泮托拉唑等。铋剂为胶体果胶铋、枸橼酸铋钾等。同时加用两种抗生素，常用抗生素为阿莫西林、呋喃唑酮、克拉霉素、多西环素等抗生素。临床上一般采用四联药物10~14天的疗程来根除该菌，即服用四联药物14天，一个月后再复查幽门螺杆菌其根除率会达到85%~90%以上。
治疗期间需要调整自己的生活方式，比如在治疗的时候要实行分餐制，避免家庭之间相互传染，不吃生食，不喝生水，注意口腔卫生。