有巧克力囊肿一侧卵巢是不会影响到排卵的。出现的囊肿比较小，过一段时间复查一下确诊就可以了。要多注意休息，过一段时间可以复查一下b超，现在可以采用中药进行调理即可。因为有巧克力囊肿是不能怀孕的，就要多注意休息，过一段时间复查确诊。