烟曲霉是能引起人、畜和禽类的肺曲霉病及其他疾病。侵染棉铃和苹果等，引起果实腐烂，或寄藏于种子上的真菌，这种菌在人免疫力低下的情况可以感染病发病，最常见的是曲霉菌支气管—肺炎。也可以见于该菌作为致敏物质刺激机体产生排斥反应，而释放炎症因子而出现过敏反应。