毛囊炎和疱疹的区别如下，致病原因不一样。毛囊炎是由于机体免疫力下降，细菌感染引起的，多为痤疮丙酸杆菌感染。疱疹是由于机体免疫力下降，病毒感染，病毒多为单纯疱疹病毒或者水痘-带状疱疹病毒。在治疗上不一样。毛囊炎的治疗可以应用抗菌消炎的药物，疱疹的治疗需要外用软膏。