扁平疣1-2年，扁平疣分布面积小，颜色与肤色接近或略显深色。3-6年，扁平疣分布面积逐渐增大，颜色成浅咖啡色或深咖啡色。6年以上，扁平疣颜色成灰褐色，表皮有角化不全和角化过度，颗粒层可增厚，乳头瘤样增生，真皮乳头增宽，呈外向型生长。