腭裂和唇裂之间虽然都是嘴巴疾病，但是两者存在一定的差别，
首先是腭裂较为常见，可单独发生，也可并发唇裂。腭裂不仅有软组织畸形，大部分腭裂患者还可伴有不同程度的骨组织缺损和畸形，在吮吸，进食及语言等生理功能障碍方面远比唇裂严重。上唇裂开称为唇裂，腭部裂开称为腭裂。通常情况下，非综合征性唇腭裂表现为同时存在唇裂和腭裂，或表现为有唇裂，没有腭裂。综合征性唇腭裂，大部分表现为有腭裂而没有唇裂。
腭裂要在2岁时候治疗最好，患儿身体状况可耐受手术，术后不影响患儿说话视为最佳手术年龄。