该药在使用过程中有一定副作用，如果使用剂量过大，容易导致肾炎，病人可以出现血尿，若及时停止使用药物症状可以缓解。怀孕期间以及哺乳期间严禁使用该药，怀孕早期使用该药，会导致胎儿畸形。使用该药过程中，严禁饮酒，否则会导致双硫仑反应，病人可以出现面色潮红、呼吸困难、恶心呕吐，严重的甚至可以危及生命，也有少数人对甲硝唑过敏。