卵巢囊肿由于性质不同有的囊肿是会自己消失，而有的囊肿不会自己消失，如果卵巢囊肿是生理性的黄体囊肿，那么就会在月经干净以后自己消失不见，如果囊肿是由于子宫内膜异位而导致引起的巧克力囊肿，那么通常是不可能自己消失，必须考虑通过手术来进行切除治疗才行，如果是普通的囊肿，一般说来囊肿小于五公分以下，可以不用进行特殊处理治疗，大于五公分就要考虑行手术切除治疗才行。