幽门螺杆菌的治疗主要为药物治疗。
抗生素(阿莫西林、呋喃唑酮、克拉霉素分散片、甲硝唑、阿莫西林克拉维酸钾等五种当中选两种)加质子泵抑制剂(奥美拉唑、泮托拉唑等选择一种)和铋剂类(果胶铋胶囊和得必泰颗粒选择一种)四联疗法，疗程14天。
之后可以继续保护胃黏膜的治疗：用药可以选择康复新液。停药后间隔一个月，消化内科就诊复查幽门螺杆菌吹气试验。平时饮食的话，注意清淡饮食，避免辛辣刺激食物，戒烟戒酒。