在太阳穴位置做自体脂肪填充手术，可能会存在后遗症。首先，有些人在不正规的医院做治疗，因为医院的医疗设备太落后，或者因为大夫的技术经验不过关，所以导致术后的整形效果不理想，这样会出现太阳穴两侧不对称的现象。其次,如果手术过程中，损害到了周围的血管,那么术后出现感染的风险会比较大，甚至可能会出现血肿，这个时候需要及时到医院做处理才行，那么术后出现感染的风险会比较大，甚至可能会出现血肿，这个时候需要及时到医院做处理才行，配合大夫使用抗感染的药物，另外，也有一部分人手术之后出现皮肤瘙痒的问题。为了能够更好的规避手术中存在的风险，尽量选择正规医院做治疗。