卵巢囊肿手术时间应选在月经干净后2-7天内，卵巢囊肿会引起育龄妇女的早期流产。若在妊娠3个月内发现患有卵巢囊肿，进行处理时容易引起流产，如果妊娠期间发现患有双侧卵巢囊肿，在手术处理中若触动子宫，则可引起流产，妊娠28周以后发现患有卵巢囊肿者，手术中极易引起早产，如大妊娠末期发现患有卵巢囊肿，则妨碍分娩，引起尿潴留或阻塞性难产。卵巢囊肿的蒂扭转，破裂或疑为恶性，不论在妊娠的任何时期均应尽速治。