巧克力囊肿是因子宫内膜到卵巢内引发的一种疾病，是子宫内膜异位症中最常见的一类。在治疗上，首先可以采取保守治疗的方法，保守治疗一般是指使用药物进行治疗，这样的药物也较多。通过药物暂时停经3-6个月，卵巢内子宫内膜也不会出血，这样卵巢内的囊肿就可能缩小。绝经期间，痛经等症状可以完全消失，但是想让卵巢内的巧克力囊肿痊愈是不太可能的，停药后仍有复发的可能。