艾滋病晚期的治疗可以减轻病情，延缓病情的进展，但是不能改变最终的结局。艾滋病晚期会出现多种机会性的感染以及恶性肿瘤，常见的感染有肺孢子菌肺炎，可以使用复方磺胺噁唑抗感染治疗，针对于真菌、病毒、寄生虫感染，应该给予相应的抗感染治疗。如果发生恶性肿瘤，在身体条件允许的情况下，可以给予放化疗等治疗。