扁平疣较好的治疗方法就是综合治疗即首先采用物理方式，如冷冻、激光等，去除疣体，再使用抗病毒药或免疫调节剂，最终达到比较好的治疗效果。其中，扁平疣的治疗主要有两种方式，一种是物理治疗，包括冷冻和激光治疗，冷冻治疗在临床上营养比较快捷、便宜。另一种是外用药物治疗，主要是抗病毒药和免疫调节剂。