男性软下疳好发于阴茎、阴囊、尿道口和肛周。临床上常见是典型的软下疳，主要见于潮湿的部位，如包皮内侧、冠状沟、尿道口和肛周，丘疹状疣，主要见于干燥部位，如阴茎干和外阴长毛的皮肤。女性软下疳则好发于阴道口、外阴、会阴和肛周，宫颈和阴道。女性软下疳主要是发生于阴道及宫颈，且宫颈HPV感染可进展为宫颈上皮瘤样病变，而且一部分免疫力低下者常于月经前后皮疹复发或加重，临床上发现女性比男性的复发率更高。