生殖器疱疹和艾滋病有着密切的关系。生殖器疱疹病人中的艾滋病的感染危险性非常大，是普通人感染艾滋的5-10倍；生殖器疱疹的病原体的感染和发病为艾滋病病毒进入机体创造了合适的条件。生殖器疱疹产生的大量溃烂面积和看不到的微型皮损给艾滋带来了方面今日机体的机会。增加了机体对艾滋病的易感性，即使艾滋病阴性的人也更容易感染艾滋病。