自体脂肪太阳穴填充的后遗症是可能会导致局部出现凹凸不平的情况，还有可能会导致局部出现大小不对称的现象。自体脂肪填充太阳穴通常能够有效的改善太阳穴凹陷的情况，但是在做自体脂肪填充太阳穴后，如果没有做好护理工作，可能会引起凹凸不平，如果注射的剂量不相同，也有可能会引起大小不对称，因此还需要提前做好手术的风险评估。还要做好局部的护理工作，并且还要避免热敷以及呆在高温的环境内，以免影响到局部的恢复。