卵巢囊肿跟怀孕是有关系的，卵巢囊肿是发生在卵巢部位的肿瘤，具体是单侧的还是双侧的，需要做手术的时候才能知晓，检测有卵巢囊肿的时候，做一个病理检查，如果是良性的，不会有问题，如果是恶性的必须立马进行手术，恶性肿瘤扩散的比较快，严重的可能会威胁胎儿的生长。