子宫畸形的发生一般是在胚胎期的过程当中受到了遗传的因素或者是环境的因素干扰而导致的。遗传因素多半是由于染色体，性染色体的异常，包括数目的异常和结构的异常。很常见的一个遗传的因素就是性染色体，正常女性是46XX，有两条X染色体，有一部分的女性只有45X。