月经总不干净在医生指导下用药调理，同时注意休息及饮食，放松心态避免劳累熬夜。考虑是月经不调的，跟近期工作压力过大导致体内激素水平变化等有关，可以先适当吃点消炎药及止血药物的，如果下次月经还这样，可以在月经第三天去医院做彩超及激素分泌六项检查一下。