卵巢巧克力囊肿是可以通过B超查和激素六项检查出来的，但要结合患者自身的症状。巧克力囊肿，对卵巢的破坏性很大，是可以造成不孕，也可做腹腔镜检查，这是目前临床上诊断卵巢巧克力囊肿效果的方法，主要是在腹腔镜的辅助下对盆腔进行窥视，能够精确的找到子宫内膜异位的位置以及病因，并且对其进行精确的诊断。