尖锐湿疣在身上较易发于尿道口、冠状沟、包皮、龟头，少数见于阴茎体部，同性恋者常发生在肛周与直肠，在肛门部常增大，状似菜花，表面湿润，在颗粒间常积有脓液，且散发出的气味恶臭，这些部位容易受微生物的感染，会导致病变部位的溃疡、化脓、出血、疼痛和肿胀。同时此病也亦在湿度较低干燥部位的生殖器疣发生，损害常小而呈扁平疣状。