月经延后可能是下丘脑、性垂体、卵巢和子宫中一处或多处发生障碍或病变引起的月经不调。应激状态下的下丘脑会分泌特定激素，作用于EOP，反过来抑制下丘脑向垂体释放激素，造成神经性内分泌障碍从而导致月经不调。这种情况可能由寒冷、环境改变、过劳或精神情感波动如应激、压抑、紧张等引起。此外，下丘脑作为神经中枢，对体重过快下降有较高敏感性，过度减肥或神经性厌食导致突然消瘦会对下丘脑产生刺激，同样可能导致闭经。比较特殊的还有军训、芭蕾、现代舞等长期的剧烈运动导致运动型闭经。性垂体病变如空蝶鞍综合症、垂体梗死、肿瘤；卵巢病变如功能性肿瘤、早衰、多囊卵巢综合症；子宫性损伤如宫腔粘连都可能导致月经不调或闭经。