尿毒症的病因主要有原发性和继发性的肾小球病变。原发性肾小球病变最常见的为慢性肾小球肾炎，继发性肾小球病变，包括糖尿病肾病，高血压肾小动脉硬化，狼疮性肾炎等。另外肾小管间质病变如慢性肾盂肾炎，慢性尿酸性肾病，梗阻性肾病，药物性肾病等也可引起尿毒症。肾血管病变，遗传性肾病也可导致尿毒症，遗传性肾病最多见的为多囊肾和遗传性肾炎。在发达国家糖尿病肾病，高血压肾小动脉硬化已成为慢性肾衰竭的主要病因。在发展中国家这两种疾病在慢性肾衰竭各种病因中仍居原发性肾小球肾炎之后，但近年来随着生活水平的改善也有明显增高的趋势。双侧肾动脉狭窄或闭塞所引起的缺血性肾病，在老年尿毒症患者中也占有重要的地位。无论何种原因导致的肾功能衰竭，只要血肌酐大于707μmoI/L或内生肌酐清除率低于十毫升每分即可称为尿毒症。