可以通过手术拔甲，不过适于单发的指甲，局麻下，将灰指甲甲拔除。这种方法创面大，出血，易引起感染。手术后一般会感觉较疼痛，容易重新感染复发，临床现已较少使用。心脏病、高血压、糖尿病等病人，不宜手术治疗。还可以内服药物，适于多个指指甲。这类药必须达到真菌所寄生的甲板处才能发挥抗菌作用，用药量大，用药时间长，应定期监测药物不良反应。