生殖器疱疹的症状是外生殖器或肛门周围有群簇或散在的小水疱，2～4天后破溃形成糜烂或溃疡，自觉疼痛，严重者可伴有出现发热、头痛、乏力等全身症状。急性发热之后，自觉患部灼痒，紧张不适，并迅即出现红斑。红斑迅速变为粟粒至绿豆大小的簇集水疱，疱液透明或混浊。水疱破裂后展出糜烂面。如无继发感染，数日后干燥结痂，痂皮脱落后可遗留暂时性色素沉着。生殖器疱疹严重者还可附近淋巴结可肿大。