问题分析：高热数天，化验检查提示C-反应蛋白显著升高；甲状腺激素系列及抗甲状腺免疫球蛋白水平显著升高，伴有肝功能异常。拟明确进一步诊疗方案。
指导建议：1）发热伴有甲状腺功能、肝功能异常，提示多器官病变，不排除自身免疫性疾病，可到风湿免疫科或消化科，以及内分泌科就诊。2）目前可考虑住院治疗，不排除自身免疫性甲状腺炎，可遵医嘱服药他巴唑，硫氧嘧啶类抗甲状腺药物；同时给予保肝治疗，如服用甘草酸二胺等保肝药。3）需要完善系列化验及辅助检查，包括自免肝抗体系列，免疫球蛋白水平，以及类风湿因子等自身抗体，嗜肝病毒抗体系列化验，进一步优化治疗方案。